Investigadores

Carbonell Cortés, Pablo Jorge

Correo Electrónico:     

pablo.carbonell@upv.es

Cargo:    

Profesor/a Titular de Universidad - PDI

Área de investigación:     

Grupo de investigación:     

Control de Sistemas Complejos

Carbonell Cortés, Pablo Jorge

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Control de Sistemas Complejos

Proyectos

Resultados de Transferencia de Tecnología

Publicaciones

  • Artículo: 2019, Efficient learning in metabolic pathway designs through optimal assembling,
    Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero 26, Volumen 52, Páginas: 7- 12
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2019.12.228
    Autores: Carbonell, Pablo; Jean-Loup Faulon; R. Breitling
  • Artículo: 2019, Highly multiplexed, fast and accurate nanopore sequencing for verification of synthetic DNA constructs and sequence libraries,
    Revista: Synthetic Biology, Numero , Volumen , Páginas: -
    DOI: https://doi.org/10.1093/synbio/ysz025
    Autores: Andrew Currin; Neil Swainston; Mark Dunstan; Adrian Jervis; Mulherin, P.; Christopher Robinson; Sandra Taylor; Carbonell, Pablo; Katherine A. Hollywood; Cunyu Yan; Eriko Takano; Nigel S. Scrutton; R. Breitling
  • Artículo: 2019, Identification of major malate export systems in an engineered malate-producing Escherichia coli aided by substrate similarity search,
    Revista: Applied Microbiology and Biotechnology, Numero , Volumen 103, Páginas: 9001- 9011
    DOI: https://doi.org/10.1007/s00253-019-10164-y
    Autores: Kurgan, Gavin; Kurgan, Logan; Schneider, Aidan; Onyeabor, Moses; Rodriguez-Sanchez, Yesenia; Taylor, Eric; Carbonell, Pablo; Martinez, Rodrigo; Xiaojian, Shi; Gu, Haiwei; Wang, Xuan
  • Artículo: 2019, Machine learning of designed translational control allows predictive pathway optimisation in Escherichia coli,
    Revista: ACS Synthetic Biology, Numero , Volumen 8, Páginas: 127- 136
    DOI: https://doi.org/10.1021/acssynbio.8b00398
    Autores: Adrian Jervis; Carbonell, Pablo; Maria Vinaixa; Mark Dunstan; Katherine A. Hollywood; Christopher Robinson; Nicholas Rattray; Cunyu Yan; Neil Swainston; Andrew Currin; Rehana Sung; Helen Toogood; Sandra Taylor; Jean-Loup Fauon; R. Breitling; Eriko Takano;
  • Artículo: 2019, Opportunities at the intersection of synthetic biology, machine learning, and automation.,
    Revista: ACS Synthetic Biology, Numero 8, Volumen , Páginas: 1474- 1477
    DOI: https://doi.org/10.1021/acssynbio.8b00540
    Autores: Carbonell, Pablo; Radivojevic, Tijiana; Garcia-Martin, Hector
  • Artículo: 2019, Pathways to cellular supremacy in biocomputing,
    Revista: Nature Communications, Numero 1, Volumen 10, Páginas: 5250-
    DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-019-13232-z
    Autores: L. Grozinger; Thomas E. Gorochowski; Martyn Amos; Carbonell, Pablo; D. Oyarzún; Rudd Stoof; H. Fellermann; P. Zuliani; H. Tas; A. Goñi-Moreno
  • Artículo: 2019, RetroRules: a database of reaction rules for engineering biology,
    Revista: Nucleic Acids Research, Numero D1, Volumen 41, Páginas: D1229- D1235
    DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gky940
    Autores: Thomas Duigou; Melchior Du Lac; Carbonell, Pablo; Jean-Loup Fauon
  • Artículo: 2019, SelProm: A queryable and predictive expression vector selection tool for Escherichia coli,
    Revista: ACS Synthetic Biology, Numero , Volumen 8, Páginas: 1478- 1483
    DOI: https://doi.org/10.1021/acssynbio.8b00399
    Autores: Adrian Jervis; Carbonell, Pablo; Sandra Taylor; Rehana Sung; Mark Dunstan; Christopher Robinson; R. Breitling; Eriko Takano; Nigel S. Scrutton
  • Artículo: 2018, An automated Design-Build-Test-Learn pipeline for enhanced microbial production of fine chemicals,
    Revista: Communications Biology, Numero , Volumen 1, Páginas: 66-
    DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-018-0076-9
    Autores: Carbonell, Pablo; Adrian Jervis; Christopher Robinson; Cunyu Yan; Neil Swainston; Maria Vinaixa; Katherine A. Hollywood; Andrew Currin; Nicholas Rattray; Sandra Taylor; Spiess, Reynard; Rehana Sung; Williams, Alan R; Fellos, Donal; Stanford, Natalie
  • Artículo: 2021, SynBiopython: an open-source software library for Synthetic Biology,
    Revista: Synthetic Biology, Numero , Volumen , Páginas: ysab001-
    DOI: https://doi.org/10.1093/synbio/ysab001
    Autores: Yeoh, Jing Wui; Neil Swainston; Vegh, Peter; Zulkower, Valentin; Carbonell, Pablo; Holowko, Maciej B; Peddinti, Gopal; Poh, Chueh Loo
  • Artículo: 2021, Prototyping of microbial chassis for the biomanufacturing of high-value chemical targets,
    Revista: Biochemical Society Transactions, Numero , Volumen , Páginas: -
    DOI: https://doi.org/10.1042/BST20200017
    Autores: Christopher Robinson; Jonathan Tellechea-Luzardo; Carbonell, Pablo; Adrian Jervis; Cunyu Yan; Katherine A. Hollywood; Mark Dunstan; Andrew Currin; Eriko Takano; Nigel S. Scrutton
  • Artículo: 2020, Rapid prototyping of microbial production strains for the biomanufacture of potential materials monomers,
    Revista: Metabolic Engineering, Numero , Volumen 60, Páginas: 168- 182
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.ymben.2020.04.008
    Autores: Christopher Robinson; Carbonell, Pablo; Adrian Jervis; Cunyu Yan; Katherine A. Hollywood; Mark Dunstan; Andrew Currin; Neil Swainston; Spiess, Reynard; Sandra Taylor; Mulherin, P.; Parker, Stephen; Rowe, William; Matthews, Nicholas E.; Malone, Kirk
  • Artículo: 2020, In silico design and automated learning to boost next-generation smart biomanufacturing,
    Revista: Synthetic Biology, Numero 1, Volumen 5, Páginas: -
    DOI: https://doi.org/10.1093/synbio/ysaa020
    Autores: Carbonell, Pablo; Rosalind le Feuvre; Eriko Takano; Nigel S. Scrutton
  • Artículo: 2020, Extended metabolic biosensor design for dynamic pathway regulation of cell factories,
    Revista: iScience, Numero 7, Volumen 23, Páginas: 1- 25
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2020.101305
    Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Picó, Jesús; Carbonell, Pablo
  • Artículo: 2020, Blood Glucose Estimation from Voice: First Review of Successes and Challenges,
    Revista: Journal of Voice, Numero , Volumen , Páginas: -
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.jvoice.2020.08.034
    Autores: Sidorova, Julia; Carbonell, Pablo; Cukic, Milena
  • Artículo: 2020, Automated engineering of synthetic metabolic pathways for efficient biomanufacturing,
    Revista: Metabolic Engineering, Numero , Volumen , Páginas: -
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.ymben.2020.11.012
    Autores: Carbonell, Pablo; Otero-Muras, Irene
  • Artículo: 2018, Selenzyme: Enzyme selection tool for pathway design,
    Revista: Bioinformatics, Numero , Volumen 34, Páginas: 2153- 2154
    DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty065
    Autores: Carbonell, Pablo; Wong, Jerry; Neil Swainston; Eriko Takano; Turmner, Nicholas J; Nigel S. Scrutton; Kell, Douglas B; R. Breitling; Faulon, Jean-Loup
  • Artículo: 2018, RetroPath2.0: A retrosynthesis workflow for metabolic engineers,
    Revista: Metabolic Engineering, Numero , Volumen 45, Páginas: 158- 170
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.ymben.2017.12.002
    Autores: Delepine, B.; Thomas Duigou; Carbonell, Pablo; Faulon, Jean-Loup
  • Artículo: 2018, PartsGenie: an integrated tool for optimising and sharing synthetic biology parts,
    Revista: Bioinformatics, Numero , Volumen , Páginas: -
    DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty105
    Autores: Neil Swainston; Mark Dunstan; Adrian Jervis; Christopher Robinson; Carbonell, Pablo; Williams, Alan R; Faulon, Jean-Loup; Nigel S. Scrutton; Kell, Douglas B
  • Capítulo de Libro: 2020, Extended Metabolic Space Modeling,
    Referencia: Synthetic Metabolic Pathways, Capítulo:  6, Páginas: 83-
    Editorial: Springer- ISBN 978-1-4939-7294-4,
    Autores: Carbonell, Pablo; Delepine, B.; Faulon, Jean-Loup
  • Capítulo de Libro: 2021, Synthetic biology design tools for metabolic engineering,
    Referencia: Microbial Cell Factories Engineering for Production of Biomolecules, Capítulo:  5, Páginas: 65-
    Editorial: Academic Press Elsevier- ISBN 978-0-12-821477-0,
    Autores: Carbonell, Pablo
  • Capítulo de Libro: 2018, Hepatotoxicity prediction by systems biology modeling of disturbed metabolic pathways using gene expression data,
    Referencia: Methods in Molecular Biology, volume "Computational Toxicology",, Capítulo:  23, Páginas: 505- 518
    Editorial: Springer- ISBN 978-1-4939-7899-1,
    Autores: Lopez, Oriol; Pastor, Manuel; Sanz, Ferran; Carbonell, Pablo