Articles

• Artículo: 2023, Advancements in synthetic biology-based bacterial cancer therapy: A modular design approach,
  Revista: Critical Reviews in Oncology/Hematology, Numero , Volumen 190, Páginas: –
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2023.104088
  Autores: Arboleda-García, Mario Andrés; Ivan Alarcon-Ruiz; Boada-Acosta, Lissette Anahi; Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Jantus-Lewintre, Eloisa
  

• Capítulo de Libro: 2023, Multi-Objective Optimization Tuning Framework for Kinetic Parameter Selection and Estimation,
  Referencia: Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems, Capítulo:  4, Páginas: –
  Editorial: Humana Press – 978-1-0716-1766-3,
  Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Picó, Jesús; Vignoni, Alejandro

• Artículo: 2023, PLATERO: A Calibration Protocol for Plate Reader Green Fluorescence Measurements,
  Revista: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Numero , Volumen 11, Páginas: –
  DOI: https://doi.org/10.3389/fbioe.2023.1104445
  Autores: A. González-Cebrián; Borràs-Ferrís, Joan; Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Ferrer, Alberto; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2022, Modeling and Optimization of a Molecular Biocontroller for the Regulation of Complex Metabolic Pathways,
  Revista: Frontiers in Molecular Biosciences, Numero , Volumen 9, Páginas: 1- 14
  DOI: https://doi.org/10.3389/fmolb.2022.801032
  Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Santos-Navarro, Fernando Nóbel; Picó, Jesús; Vignoni, Alejandro
  

• Tesis: 2022, Multi-scale host-aware modeling for analysis and tuning of synthetic gene circuits for bioproduction
  Fecha de publicación: 20/05/2022
  Autor: Fernando Nóbel Santos Navarro,
  Director/es:

• Artículo: 2022, Multicolor plate reader fluorescence calibration,
  Revista: Synthetic Biology, Numero 1, Volumen 7, Páginas: –
  DOI: https://doi.org/10.1093/synbio/ysac010
  Autores: Vignoni, Alejandro; Boada-Acosta, Yadira Fernanda
  

• Artículo: 2022, OneModel: an open-source SBML modeling tool focused on accessibility, simplicity and modularity,
  Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero , Volumen , Páginas: 125- 130
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2022.07.432
  Autores: Santos-Navarro, Fernando Nóbel; Navarro Herrero, José Luís; Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2022, Optimization of the dynamic regulation in a branch-in metabolic pathway,
  Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero , Volumen , Páginas: 119- 124
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2022.07.431
  Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Santos-Navarro, Fernando Nóbel; Vignoni, Alejandro; Picó, Jesús
  

• Capítulo de Libro: 2021, Stochastic Differential Equations for Practical Simulation of Gene Circuits.,
  Referencia: Synthetic Gene Circuits. Methods and Protocols, Capítulo:  2, Páginas: 41-
  Editorial: Springer- ISBN 978-1-0716-1031-2,
  Autores: Picó, Jesús; Vignoni, Alejandro; Boada-Acosta, Yadira Fernanda

• Artículo: 2021, RBS and Promoter Strengths Determine the Cell-Growth-Dependent Protein Mass Fractions and Their Optimal Synthesis Rates,
  Revista: ACS Synthetic Biology, Numero 12, Volumen 10, Páginas: 3290- 3303
  DOI: 10.1021/acssynbio.1c00131
  Autores: Santos-Navarro, Fernando Nóbel; Vignoni, Alejandro; Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2021, Alkylation of a hydrophilic photosensitizer enhances the contact-dependent photo-induced oxidation of phospholipid membranes,
  Revista: Dyes and Pigments, Numero 109131, Volumen 187, Páginas: 1- 10
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.dyepig.2020.109131
  Autores: Vignoni, Alejandro; Carla Layana; Helena C. Junqueira; Andrés Thomas; Rosangela Itri; Mauricio S. Baptista; Mariana Vignoni
  

• Artículo: 2021, Gene Expression Space Shapes the Bioprocess Trade-Offs among Titer, Yield and Productivity,
  Revista: Applied Sciences, Numero 13, Volumen 11, Páginas: 5859-
  DOI: https://doi.org/10.3390/app11135859
  Autores: Santos-Navarro, Fernando Nóbel; Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2020, Extended metabolic biosensor design for dynamic pathway regulation of cell factories,
  Revista: iScience, Numero 7, Volumen 23, Páginas: 1- 25
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2020.101305
  Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Picó, Jesús; Carbonell, Pablo
  

• Artículo: 2020, Multiobjective Identification of a Feedback Synthetic Gene Circuit,
  Revista: IEEE Transactions on Control Systems Technology, Numero 1, Volumen 28, Páginas: 208- 223
  DOI: https://doi.org/10.1109/TCST.2018.2885694
  Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2019, Biomolecular signal tracker with fast time response.,
  Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero 26, Volumen 52, Páginas: 1- 6
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2019.12.227
  Autores: De Battista, Hernán; Picó, Jesús; Picó-Marco, Enric ; Vignoni, Alejandro
  

• Artículo: 2019, Characterization of gene circuits parts based on multi-objective optimization using standard calibrated measurements,
  Revista: ChemBioChem, Numero , Volumen 20, Páginas: 2653- 2665
  DOI: https://doi.org/10.1002/cbic.201900272
  Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; Ivan Alarcon-Ruiz; Carlos Andreu-Vilarroig; Roger Monfort-Llorens; Adrián Requena; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2019, Fluorescence calibration and color equivalence for quantitative synthetic biology,
  Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero 26, Volumen 52, Páginas: 129- 134
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2019.12.247
  Autores: Vignoni, Alejandro; Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Lisset Boada-Acosta; Carlos Andreu-Vilarroig; Ivan Alarcon-Ruiz; Adrián Requena; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2019, Model mismatch in multi-objective optimisation and preservation of trade-off order,
  Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero 26, Volumen 52, Páginas: 249- 254
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2019.12.266
  Autores: Reynoso Meza, Gilberto; Vignoni, Alejandro; Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Picó, Jesús; Picó-Marco, Enric
  

• Artículo: 2018, Host-circuit interactions explain unexpected behavior of a gene circuit.,
  Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero 19, Volumen 51, Páginas: 86- 89
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2018.09.030
  Autores: Boada-Acosta, Yadira Fernanda; Vignoni, Alejandro; D. Oyarzún; Picó, Jesús
  

• Artículo: 2018, Multi-objective identification from fluorescence recovery after photobleaching experiments: Understanding morphogenetic regulation of epithelial polarity,
  Revista: IFAC-PapersOnLine, Numero 19, Volumen 51, Páginas: 8- 11
  DOI: https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2018.09.009
  Autores: Vignoni, Alejandro; A. Bajur; E. Knust; I. F. Sbalzarini