Problema a resolver

En el ámbito de la producción industrial sostenible de biomoléculas en biofoundries, surge la necesidad de contar con herramientas software que cubran las etapas de Diseño-Implementación-Análisis-Aprendizaje (DBTL) de una forma sistemática y automatizada, que permite cubrir la demanda de forma eficiente y distribuida. Para ello, es necesario el desarrollo de un conjunto de herramientas software que ejecuten las diferentes etapas de la cadena de una forma concertada y con el empleo de formatos de datos estandarizados.

Tecnología ofertada

El Instituto Universitario de Automática e Informática Industrial de la Universitat Politènica de València participa en el desarrollo del proyecto de código abierto Galaxy-SynBioCAD, que proporciona un sistema integrado bajo la plataforma Galaxy para el desarrollo de flujos de trabajo empleando las herramientas software del ciclo DBTL.

Esta plataforma nos ofrece, entre otras, las siguientes herramientas:

• RetroPath 2.0: para la búsqueda de rutas de bioproduccción.
• Selenzyme: para la selección de las enzimas en la ruta de bioproducción.
• Selección de las partes de ADN y generación de las instrucciones de ensamblado de las partes empleando robots de manejo de líquidos como OpenTrons.

Además, el sistema puede integrarse con una herramienta de desarrollo de biosensores para la regulación dinámica de la ruta de producción.

Equipo desarrollador

El grupo de Área de Control de Procesos, responsable de este desarrollo, cuenta con más de 10 años de experiencia en el ámbito de biotecnología, ha participado en más de 10 proyectos de investigación nacionales y europeos, y cuenta con más de 60 trabajos científicos en revistas.

Estado de desarrollo y protección

SynBioCAD está actualmente disponible como una herramienta de código abierto que puede instalarse localmente o ser empleada online. Este software está registrado por la Universitat Politècnica de València

Colaboración deseada

Se busca empresa interesada en funcionalidades adicionales que puedan integrarse en la plataforma de flujo de trabajo, tales como el escalado, optimización, diseño experimental, cribado, etc.